Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd11Q1RNF8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms