Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Cpne9Q1RLL3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Cpne9Q1RLL3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cpne9Q1RLL3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Cpne9Q1RLL3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cpne9Q1RLL3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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