Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim71Q1PSW8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim71Q1PSW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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