Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ptchd1Q14B62 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ptchd1Q14B62 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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