Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpusd3Q14AI6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpusd3Q14AI6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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