Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

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Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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VgfQ0VGU4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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VgfQ0VGU4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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VgfQ0VGU4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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VgfQ0VGU4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VgfQ0VGU4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VgfQ0VGU4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms