Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc162pQ0VG85 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms