Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp2b3Q0VF55 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atp2b3Q0VF55 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms