Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Itgb8Q0VBD0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms