Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vps8Q0P5W1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms