Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spata18Q0P557 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Spata18Q0P557 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms