Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cnnm1Q0GA42 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms