Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cass4Q08EC4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cass4Q08EC4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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