Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
MitfQ08874 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms