Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SctQ08535 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SctQ08535 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SctQ08535 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SctQ08535 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms