Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
NrepQ07475 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms