Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Cdx4Q07424 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms