Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Prrx2Q06348 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms