Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cab39Q06138 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms