Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Thbs3Q05895 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms