Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fmn1Q05860 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fmn1Q05860 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms