Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sox12Q04890 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms