Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sox9Q04887 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox9Q04887 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms