Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cxcr5Q04683 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms