Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RelaQ04207 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RelaQ04207 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms