Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nucb1Q02819 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nucb1Q02819 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms