Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nhlh1Q02576 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nhlh1Q02576 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms