Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Zfp39Q02525 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Zfp39Q02525 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms