Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd1Q01822 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms