Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec23aQ01405 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec23aQ01405 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms