Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Col1a2Q01149 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms