Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Grin2cQ01098 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin2cQ01098 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms