Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F8a1Q00558 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F8a1Q00558 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F8a1Q00558 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F8a1Q00558 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F8a1Q00558 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
F8a1Q00558 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms