Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Npas2P97460 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Npas2P97460 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms