Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkp1P97350 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkp1P97350 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms