Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H3f3aP84244 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H3f3aP84244 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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