Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx3P81067 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx3P81067 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms