Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NficP70255 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NficP70255 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NficP70255 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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NficP70255 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NficP70255 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NficP70255 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms