Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hoxd13P70217 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxd13P70217 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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