Protein–RNA interactions for Protein: P63006

Lhx1, LIM/homeobox protein Lhx1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx1P63006 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lhx1P63006 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lhx1P63006 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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