Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rps3P62908 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rps3P62908 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rps3P62908 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms