Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rps11P62281 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps11P62281 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms