Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Itga11P61622 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Itga11P61622 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Itga11P61622 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms