Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ube2kP61087 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ube2kP61087 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms