Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ythdf1P59326 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ythdf1P59326 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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