Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fermt1P59113 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fermt1P59113 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms