Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
P58686 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P58686 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P58686 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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