Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd4P58467 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd4P58467 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Setd4P58467 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms