Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NcstnP57716 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NcstnP57716 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms