Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf5P56477 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf5P56477 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms